Aktualności

Dane Laboratorium Genomiki i Analiz Epigenetycznych Uniwersytetu Medycznego w Białymstoku zostały poddane certyfikacji jakości sekwencjonowania metodą NGS (Next-Generation-Sequencing).

We wszystkich trzech parametrach jakości, wygenerowane dane sekwencyjne uzyskały najwyższe wartości. Dzięki temu laboratorium Centrum Badań Klinicznych UMB zostało najwyżej sklasyfikowaną jednostką z blisko 130 ośrodków z całego świata, które wykonują badania w systemie Illumina NovaSeq 6000!

Sukces jest ukoronowaniem wielu lat ciężkiej pracy, którą wykonuje cały zespół  laboratorium. Ocenę przeprowadziła Europejska Sieć Kontroli Jakości Badań Genetycznych (EMQN - European Molecular Genetics Quality Network) i agencja Oceny Jakości Genomicznej (GenQA - Genomic Quality Assessment).

Laboratorium Genomiki i Analiz Epigenetycznych, Centrum Badań Klinicznych Uniwersytetu Medycznego w Białymstoku (CBK UMB), którego liderem jest dr Magdalena Niemira, wykonuje szeroki zakres analiz w oparciu o sekwencjonowanie DNA metodami następnej generacji (NGS – Next Generation Sequencing). W CBK UMB wykonywane są m.in. analizy transkryptomiczne, w których oceniana jest ekspresja genów (total RNA-Seq, mRNA-Seq), krótkiego niekodującego RNA (smallRNA-Seq), a także analizy metylomu, dotyczące zmian w profilu i poziomie metylacji DNA (RRBS) oraz badania zmienności genetycznej germinalnej i somatycznej w metodach sekwencjonowania całoeksomowego (WES) lub całogenomowego (WGS). Technologia sekwencjonowania NGS umożliwia równoległe sekwencjonowanie wielu milionów cząsteczek DNA/RNA, co pozwala na jednoczesną i bardzo szybką analizę wielu próbek na raz.

Wykonane przez Laboratorium Genomiki i Analiz Epigenetycznych CBK UMB sekwencjonowania całoeksomowe (WES) ok. 1400 pacjentów zakażonych wirusem SARS-CoV-2 były wykorzystywane do poszukiwania genetycznych czynników wpływających na różnice w przebiegu choroby COVID-19 u różnych osób. Wyniki tych badań zostaną wkrótce również opublikowane w postaci artykułu naukowego. Opracowany w ramach projektu model predykcji ilorazu szans na ciężki przebieg COVID-19 na podstawie danych obejmujących wiek, płeć i BMI został zaimplementowany w zeszłym miesiącu w postaci kalkulatora przez Ministerstwo Zdrowia w serwisie pacjent.gov (https://pacjent.gov.pl/aktualnosc/sprawdz-jak-mozesz-przechodzic-covid-19).

Laboratorium Genomiki i Analiz Epigenetycznych CBK UMB świadczy również usługi sekwencjonowania DNA z użyciem technologii NGS dla zewnętrznych ośrodków naukowych i firm komercyjnych poprzez dedykowany podmiot Genomika Polska sp. z. o.o. (https://genomikapolska.pl). Obecnie, Genomika Polska i CBK UMB oferują usługi oparte o metody WES, WGS i RNA-seq jako prace zlecone na potrzeby badań naukowych i diagnostycznych dla klientów z całej Polski. Laboratorium CBK UMB współpracuje z wiodącymi ośrodkami naukowymi w USA, oraz Europie.  Laboratorium pracuje w obszarze chorób cywilizacyjnych takich jak: nowotwory, cukrzyca, czy otyłość.